Les défricheurs qui ouvrent, vers 1830, le territoire situé immédiatement au sud de Saint-Octave-de-Dosquet, dans la région administrative de la Chaudière-Appalaches, MRC de Lotbinière, étaient en majorité des Irlandais. Or, comme sainte Agathe est une vierge martyre très honorée des Irlandais, on a retenu son nom pour identifier la paroisse érigée canoniquement en 1853, dont le territoire appartenait auparavant à Saint-Gilles, de même que le bureau de poste établi en 1858. L’histoire municipale se résume à ceci : la municipalité du canton de Nelson est créée en 1855 alors que la municipalité de la paroisse de Sainte-Agathe l’est en 1857; en 1914, la municipalité du village de Sainte-Agathe est créée à la suite de son détachement de la municipalité de paroisse; en 1985, le regroupement de la municipalité de paroisse et de la municipalité de canton donne naissance à la nouvelle municipalité de la paroisse de Sainte-Agathe; en 1999, est constituée la municipalité de Sainte-Agathe-de-Lotbinière à la suite du regroupement de la municipalité de village et de la municipalité de paroisse. Ainsi, dans l’histoire, l’amiral anglais Horatio Nelson (1758-1805), vainqueur de Trafalgar, voisine avec la vierge martyre Agathe. Assassinée en 251, cette jeune femme a dû subir d’affreux tourments pour avoir repoussé les avances d’un fonctionnaire romain. Le village est situé à un carrefour routier assez ancien et d’importance régionale, celui des routes 218 et 271. L’une de ces voies correspond à l’ancien chemin Gosford, toujours l’un des odonymes principaux de l’endroit. C’est d’ailleurs le tracé des chemins Craig et Gosford qui a favorisé le peuplement de cette région vers le milieu du XIXe siècle. On relève sur les deux territoires des patronymes anglais comme Allen, Brady, Cameron, Maguire, McGinley, Powell…, assortis fréquemment de prénoms français. Les nombreux cours d’eau qui coulent sur ce territoire, notamment les rivières du Chêne, Palmer, aux Chevreuils et Saint-Georges permettent aux Agathois de s’adonner à la pêche et ont contribué à faire de l’endroit un des lieux enchanteurs de la région. On peut y admirer un pont couvert assez célèbre sur la Palmer, près de jolies chutes, le pont Rouge. Construit en 1928, il mesure 40 m et constitue le plus long des trois ponts couverts de Lotbinière.